Niegdyś Jokohama była tylko wioską rybacką, ale teraz, na początku ery Meiji, staje się portem otwartym dla obcych krajów i jednym z wiodących miast handlowych Japonii. W rezultacie wiele japońskich produktów, takich jak miedź i surowy jedwab, jest zbieranych w Jokohamie na eksport do innych krajów. Jednocześnie miasto zaczyna wdrażać zagraniczną technologię i kulturę, a nawet ulice stają się coraz bardziej modernizowane. Wielu kupców z Jokohamy znalazło się wówczas w cieniu tego rozwoju.

W grze YOKOHAMA każdy gracz jest kupcem w okresie Meiji, próbującym zdobyć sławę dzięki udanemu biznesowi, a w tym celu musi zbudować sklep, poszerzyć swoje kanały sprzedaży, nauczyć się różnych technik i (oczywiście) realizować zamówienia z zagranicy.