Głównym celem w Pocket Mars jest przygotowanie czerwonej planety na przybycie większej ilości ludzi. W tym celu będziecie wysyłać kolonistów i projekty architektoniczne do budynków już znajdujących się na tytułowej planecie. Budowle zaś trzeba będzie rozbudowywać, tworząc nowe, nadające się do zamieszkania konstrukcje.