W Myrmes gracze kontrolują kolonie mrówek i używają ich do eksploracji ziemi, zbierania „upraw”, walczenia z innymi mrówkami; wypełniania poleceń Królowej by dominować na ich maleńkim skrawku ziemi. Wszystkie te akcje pozwalają na zdobycie punktów zwycięstwa. Po trzech sezonach grzebania i żerowania każda kolonia mrówek czeka ciężka zima, która wystawi na próbę jej kolonialną siłę.

Każdy gracz ma indywidualną planszę do gry. Wspólna plansza przedstawia krajobraz poza tunelem wyjściowym, który dzielą wszystkie kolonie; po wyjściu z tego tunelu robotnice mogą poruszać się po terenie, aby umieszczać feromony.